Hi Sebastian,
bei meinem 6.3 kamn vorne Wasser durch eine lose Tülle im Stehblech (=Spritzwand, also Wand zum Motorraum). Hinten kam Wasser durch ein werksseitiges Loch unterhalb vom Scheibenrahmen an der C-Säule, wo der Stopfen fehlte.
Vllt hilft diese Info.
Ansonsten:
- Wagen von innen und aussen trocknen
- Teppiche raus, evtl auch Rücksitzbank
- optional: innen die Seiten mit Mehl (oder Koks, je nach Präferenz 
) bestäuben. Wasser hinterlässt da charakteristische Spuren.
- von aussen und auf mittlerer Höhe beginnend, Stück für Stück (!) der Karosserie mit feinem Wasserschlauch ansprühen (jeweils 5..10 Minuten), dann von innen mit Taschenlampe kontrollieren.
- dabei unbedingt von unten nach oben vorgehen, denn wenn du nur das Dach beregnest, kann es sein, dass das Wasser trotzdem von unten in den Wagen eindringt und du vergeblich am Dach suchst.
Viel Erfolg
Tom